Pääradan välityskyvyssä on vakavia puutteita Tampereen ja Seinäjoen välisellä osuudella. Radassa on pehmeikköjä, jotka rajoittavat akselipainoja ja ajonopeuksia. Pehmeikköjen parantamista on suunniteltu, mutta toimenpiteiden toteuttamisesta ei ole päätöksiä. Lisäksi yksiraiteisuus aiheuttaa liikenteelle merkittäviä viivästyksiä.  

Suurin osa kohtaamisista sijoittuu liikennepaikkaväleille Karhejärvi—Vahojärvi ja Ratikylä—Ylivalli. Kohtaamisongelmat voidaan poistaa lähes kokonaan kyseisille väleille sijoitettavilla kaksoisraideosuuksilla. Tarvittavien kaksoisraideosuuksien tarkempi kohdentaminen edellyttää aluksi aluevaraussuunnitelman laatimista.